淮南軍分區(qū)的前身為淮南煤礦警備區(qū)，歷經(jīng)三次調(diào)整。1952年5月成立淮南市人民武裝部，1983年5月由正團級升格為正師級，1985年10月成立淮南軍分區(qū)。軍分區(qū)下轄6個人武部，1個干休點。全市有大型企業(yè)、實驗區(qū)武裝部3個，基層武裝部103個，基干民兵總數(shù)為9千余人。軍分區(qū)現(xiàn)有機關(guān)辦公營區(qū)、老區(qū)營院和干休點、民兵訓(xùn)練基地4個營區(qū)。機關(guān)辦公營區(qū)于2004年11月建成使用，民兵訓(xùn)練基地于2011年5月竣工使用。

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